Футбольный клуб Кайрат был основан в 1954 году в городе Алма-Ата, который в то время был столицей Казахской ССР. Как и многие другие футбольные клубы СССР, его основали на основе коллективов отдельных предприятий. В этом случае это был коллектив завода «Кайрат», который производил продукцию для авиационной промышленности. Название клуба было выбрано в честь этого завода. Сам же клуб был основан с целью участия в чемпионате Казахской ССР по футболу.

С течением времени футбольный клуб Кайрат стал одной из самых успешных команд страны. В 1966 году клуб вышел в высшую лигу Советского Союза и провел там более 15 лет. В течение своей истории клуб многократно менял название и цвета команды, а также крепко укрепил свою репутацию как одна из самых сильных и профессиональных в Казахстане. Сегодня футбольный клуб Кайрат продолжает свою историю, представляя национальную премьер-лигу Казахстана и являясь символом футбола и города Алма-Аты.